ในที่สุดสถานีฮาราจุกุอันเป็นสัญลักษณ์ของโตเกียวก็ได้ถูกแทนที่ ในวันเสาร์ที่ 21 มีนาคม 2020 สถานีแห่งใหม่ได้เปิดให้บริการในยุคใหม่แก่นักเดินทางบนเส้นทางรถไฟสายที่ค่อนข้างคึกคัก JR Yamanote ของโตเกียว
สถานีฮาราจุกุแห่งใหม่นี้ ตั้งอยู่ข้างอาคารสถานีเก่า เป็นอาคารที่ทันสมัย เปิดรับแสงสว่างโดยการใช้กระจกใสและดูกว้างขวาง สร้างขึ้นเพื่อเตรียมพร้อมสำหรับการแข่งขันกีฬาโอลิมปิคและพาราลิมปิค โตเกียว 2020 สถานีสองชั้นแห่งใหม่นี้ตั้งอยู่ข้างสถานีเก่า โดยมีศาลเจ้าเมจิที่มีชื่อเสียงอยู่เบื้องหลัง และมีถนน Omotesando-dori อันพลุกพล่านอยู่ด้านหน้า
สถานีฮาราจุกุเก่าสร้างขึ้นเมื่อเกือบหนึ่งศตวรรษที่แล้ว ด้วยโครงสร้างไม้ที่ได้รับการพัฒนาจากผู้ที่ชื่นชอบเสน่ห์อันเป็นเอกลักษณ์และความรู้สึกของโลกยุคเก่า ในแต่ละวันจะมีผู้โดยสารราว 70,000 คนใช้สถานีนี้ และในช่วงปีใหม่จำนวนตัวเลขได้เพิ่มขึ้นเป็นเกือบสามล้านคน เจ้าหน้าที่ได้สรุปว่า สถานีเดิมไม่สามารถปฏิบัติตามกฎระเบียบด้านสุขภาพและความปลอดภัยของยุคใหม่ได้อีกต่อไป และแม้จะมีความรู้สึกว่ามีเยื่อใยตัวอาคารเก่า แต่การก่อสร้างสถานีใหม่ก็เริ่มขึ้นในปี 2559
ผลลัพธ์ที่ได้คือการออกแบบที่กว้างขวางและทันสมัยขึ้น ผนังกระจกของสถานีเปิดรับแสงอย่างเต็มที่ นับว่าเป็นการเปิดบรรยากาศของสถานที่ที่โดดเด่นที่สุดแห่งหนึ่งของโตเกียว สถานีใหม่นี้ยังมีร้านสะดวกซื้อบนชั้นหนึ่ง และร้านกาแฟบนชั้นสอง และยังคงสามารถมองเห็นสถานีเก่าได้จากสถานีใหม่ หมายกำหนดการรื้อถอนอาคารสถานีเก่า อย่างเร็วที่สุดก็คงเป็นหลังการแข่งขันกีฬาโอลิมปิคและพาราลิมปิค องค์ประกอบของการออกแบบทางประวัติศาสตร์ของสถานีเก่าจะรวมเข้าในอาคารพาณิชย์ใหม่ ที่จะสร้างขึ้นมาแทนที่
นอกจากศาลเจ้าเมจิจินกุและโอะโมะเตะซันโดะ โดะริแล้ว สถานีฮาราจุกุแห่งใหม่ยังคงให้การเข้าถึงสวนโยะโยะงิ รวมถึงถนนช้อปปิ้งอันคึกคักที่ขับเคลื่อนด้วยวัฒนธรรมวัยรุ่น ทะเคะชิตะโดริและบริเวณโดยรอบ