ศาลเจ้าอิเสะ (อิเสะ จินกุ) ประกอบด้วยศาลเจ้าสองศาลเจ้า (ไนกุ และ เกะคุ) และศาลเจ้าเล็กๆ อีก 123 ศาลเจ้า ศาลเจ้าไนกุ (Naiku) เป็นที่ประดิษฐานของเทพเจ้าแห่งดวงอาทิตย์ เทพเจ้าแห่งบรรพบุรุษขององค์จักรพรรดิ และเทพเจ้าแห่งบรรพบุรุษของญี่ปุ่น ตามตำนานกล่าวไว้ว่า เมื่อ 2000 ปีที่แล้วเทพเจ้าแห่งดวงอาทิตย์ได้เสด็จออกจากวัง และเดินทางไปหลายๆ สถานที่ ในที่สุดก็มาสถิตย์ใกล้แม่น้ำอิซุซุ (Isuzu) ซึ่งขณะนี้คือ ศาลเจ้าไนกุ อาคารทุกอาคารได้สร้างขึ้นใหม่ในทุกๆ 20 ปี และเป็นเช่นนี้มานานกว่า 1300 ปี วิธีนี้อาจเป็นวิธีที่ยอดเยี่ยมสำหรับนิรันดร